The
амінокислоти є число, що представляє гідрофобні або гідрофільні властивості його бічного ланцюга. Його запропонували в 1982 році Джек Кайт і Рассел Ф. Дуліттл. Чим більше число, тим більш гідрофобна амінокислота. Найбільш гідрофобними амінокислотами є ізолейцин (4,5) і валін (4,2).
Починається на амінокінці. Для побудови індексу використовується вікно з 20 амінокислот. Починаючи з перших 20 амінокислот.
Контактний кут краплі рідини на поверхні вказує на те, наскільки поверхня є гідрофобною чи гідрофільною. Чим більший кут контакту, тим менш змочувана (більш гідрофобна) поверхня.
А) Розкриває сюжет гідропатії один або кілька регіонів з високим індексом гідропатії. B) Домени, які виступають на цитоплазматичній поверхні плазматичної мембрани, майже завжди мають ковалентно приєднані олігосахариди.
Обчисліть велике середнє значення гідропатії (GRAVY) для білкових послідовностей. Значення GRAVY визначається сума значень гідропатії всіх амінокислот, поділена на довжину білка.
Індекс гідропатії амінокислоти число, що представляє гідрофобні або гідрофільні властивості його бічного ланцюга. Його запропонували в 1982 році Джек Кайт і Рассел Ф. Дуліттл. Чим більше число, тим більш гідрофобна амінокислота. Найбільш гідрофобними амінокислотами є ізолейцин (4,5) і валін (4,2).