Fallout 4 дозволяє гравцям приєднатися до всіх чотирьох основних фракцій гри. Зрештою, однак, настане момент, коли їм доведеться зробити вибір. Перехід на сторону певних фракцій зіпсує стосунки гравця з іншими, що ускладнить перегляд усіх можливих кінців протягом одного проходження.
У Fallout 4, ви можете грати разом з усіма фракціями до певного моменту. Гра розроблена таким чином, що ви можете досить довго працювати із Залізницею, Братством сталі, Minutemen та Інститутом. Однак вибір, який ви зробите, зрештою змусить вас стати на бік однієї фракції замість інших.
The Minutemen є опцією «за замовчуванням» для багатьох гравців, які хочуть випробувати якомога більше квестів інших фракцій. Жодна інша фракція не вважає Minutemen ворогами, тому можна приєднатися до Minutemen, Братства та Залізниці або, як альтернатива, стати на бік Інституту та залишити Minutemen союзниками.
Що б ти не робив, принаймні 1 фракція буде знищена. Якщо ви закінчите гру з Minutemen, ви зможете зберегти Залізницю та Братство, але Інститут буде знищено. Це фінал із найбільшою кількістю фракцій, які вижили. Є мод.
Якщо ви остаточно присягнете на вірність фракції залізниці у Fallout 4, ви більше не зможете виконувати квести або зв’язуватися з союзниками інших фракцій. І Інститут, і Братство Сталі стануть постійними ворогами.