У ДНК 5' вуглець розташований у верхній частині провідного ланцюга, а 3' вуглець розташований у нижній частині відстаючого ланцюга. Послідовності нуклеїнових кислот є комплементарними та паралельними, але вони йдуть у протилежних напрямках, отже антипаралельне позначення.
ДНК дволанцюгова, а нитки антипаралельні, оскільки вони біжать у протилежних напрямках. Кожна молекула ДНК має два ланцюги нуклеотидів. Кожен ланцюг має цукрово-фосфатну основу, але орієнтація молекули цукру в двох ланцюгах протилежна.
Н-зв’язки – полінуклеотидний ланцюг має цукровий і фосфатний скелет, а основи розташовані під прямим кутом до нього. Отже, правильна відповідь: «ланцюги ДНК антипаралельні через Н-зв'язки.”
Обидва ланцюги подвійної спіралі ДНК можуть рости в напрямку від 5' до 3', але вони ростуть у протилежних напрямках через протилежну орієнтацію молекули цукру в них. Антипаралельна орієнтація дозволяє парам основ доповнювати одна одну. Антипаралельна ДНК також більш структурно стабільна, ніж паралельна ДНК.
Оскільки два ланцюги подвійної спіралі ДНК антипаралельні, це Синтез ДНК від 5′ до 3′ може відбуватися безперервно лише на одному з ланцюгів у вилці реплікації (провідний ланцюг). На відстаючому ланцюзі короткі фрагменти ДНК повинні бути зроблені за допомогою процесу «зшивання назад».
Основна причина того, що антипаралельні бета-ланцюгові білкові структури більш стабільні, ніж паралельні бета-ланцюгові структури, полягає в тому, що природа водневих зв’язків. В антипаралельних бета-листах водневі зв’язки розташовані прямо навпроти один одного, що робить їх коротшими та міцнішими.