одно-
секвенування передбачає секвенування ДНК лише з одного кінця, і це найпростіший спосіб використання
. На відміну від одноразової послідовності читання, парне секвенування дозволяє користувачам секвенувати обидва кінці фрагмента і генерувати високоякісні, вирівнювані дані послідовності.
Як працює Illumina NGS? Технологія Ilumina NGS використовує принципово відмінний підхід від класичного методу обриву ланцюга Sanger. Він використовує технологію секвенування шляхом синтезу (SBS) – відстеження додавання мічених нуклеотидів під час копіювання ланцюга ДНК – у масово паралельний спосіб.
Нанопорові детектори дозволяють одній нитці ДНК проходити крізь крихітну пору та секвенувати її під час проходження.
Illumina NGS пропонує гнучкість змінних розмірів вставок і довжини зчитування (35–300 п.о), що дозволяє охарактеризувати будь-який геном з високою роздільною здатністю. Аналіз даних є важливим фактором, який слід враховувати для програм секвенування.
У даних Illumina всі зчитування послідовностей, згенеровані під час одного експерименту, мають однакову довжину, тоді як довжини зчитувань Ion Torrent відрізняються. Крім того, поточне покоління інструментів Illumina може генерувати зчитування послідовності з обох кінців фрагмента (зчитування з «парного кінця»), тоді як Ion Torrent не може.
Розуміння основних етапів робочого процесу NGS
- Крок 1: Екстракція нуклеїнової кислоти. Загальний робочий процес для експерименту NGS починається з ізоляції генетичного матеріалу. …
- Крок 2: Підготовка бібліотеки. …
- Крок 3: Секвенування. …
- Крок 4: Аналіз та інтерпретація даних.