Амінокислотний скелет складається з гідрофільні аміногрупи, карбоксильні групи та гідрофобні бічні ланцюги.
полярний гідрофільний NH2 поблизу карбонілу утворює амід, якому не подобається діяти як кислота чи основа за стандартних фізіологічних умов. Однак, з частковими зарядами та здатністю до зв’язування H як у карбонільному кисню, так і в групах NH2, ми отримуємо полярні гідрофільні амінокислота.
Гідрофільні амінокислоти є полярними в той час як гідрофобні амінокислоти є неполярними, це основна відмінність між ними.
гідрофільний Серед в гідрофільний функціональними групами є карбоксильна група, що міститься в амінокислотах, деяких бічних ланцюгах амінокислот і головках жирних кислот, які утворюють тригліцериди та фосфоліпіди.
Хоча сульфгідрильні групи зазвичай мають нейтральний заряд, вони полярні і гідрофільні, що дозволяє їм взаємодіяти з водними розчинами.
Амінокислоти згруповані відповідно до того, як виглядають їхні бічні ланцюги. Дев’ять амінокислот, які мають гідрофобні бічні ланцюги, це гліцин (Gly), аланін (Ala), валін (Val), лейцин (Leu), ізолейцин (Ile), пролін (Pro), фенілаланін (Phe), метіонін (Met), і триптофан (Trp).